Hạt từ là một trong những lựa chọn thường được sử dụng để tinh sạch DNA vì khá đơn giản và hiệu quả. Tuy nhiên, những kỹ thuật tưởng chừng khá đơn giản thì đôi khi vẫn có thể có những sai sót và kết quả thu được không tốt. Do đó, để đảm bảo hiệu quả, 7 lời khuyên dưới đây sẽ giúp bạn có được kết quả tinh sạch DNA tốt nhất khi sử dụng hạt từ:

1. Không làm đông dung dịch hạt từ

Luôn giữ dung dịch hạt bead từ ở 2 – 8^oC, việc làm đông và rã đông có thể làm vỡ bề mặt hạt bead, dẫn đến nhiễm vào mẫu.

2. Để hạt bead từ về nhiệt độ phòng trước khi sử dụng

Cần có kế hoạch trước và để hạt bead về nhiệt độ phòng khoảng 30 phút trước khi sử dụng. khoảng thời gian này đủ để làm ấm hạt bead.

3. Lắc đều hạt bead trước khi sử dụng 

Khi lấy dung dịch hạt bead từ nơi bảo quản, có thể bạn sẽ thấy hạt bead bị lắng xuống hoặc tụ lại một chỗ mà không đồng đều, do đó cần vortex hạt bead ngay lập tức trước khi sử dụng, hãy vortex cho đến khi dung dịch hạt bead được đồng nhất và tất cả đều tan hoàn toàn. 

4. Xác định được tỉ lệ hạt bead : DNA

Lượng đầu vào hạt bead liên quan trực tiếp tới lượng DNA mà bạn có, nếu cho quá nhiều hạt bead thì bead sẽ bị nhiễm vào mẫu, ngược lại nếu cho quá ít thì có thể sản lượng thu hồi bị thấp.

5. Lựa chọn giá tách từ phù hợp

Lựa chọn kích thước của giá tách từ phù hợp với lượng mẫu bạn tinh sạch.

6. Thao tác pipet cẩn thận

 + Khi hút các dung dịch rửa, hút nhẹ nhàng, từ từ.

 + Không nên hút quá nhanh vì nếu lực hút quá mạnh có thể khiến hút nhầm cả hạt bead.

7. Kiểm tra lượng mẫu bị mất

Nếu muốn xem lượng hạt bead từ (hay chính là lượng mẫu) bị hao hụt sau mỗi lần rửa, hãy giữ lại tất cả các dung dịch rửa đã hút bỏ sau mỗi lần rửa, gộp lại và để vào giá tách từ và quan sát thử xem lượng hạt bead bị mất đi sau mỗi lần rửa là bao nhiêu, có thể sẽ không định lượng được chính xác nhưng đôi khi giúp bạn giải thích được tại sao một số mẫu lại cho kết quả tốt hơn các mẫu khác để từ đó tìm ra cách giải quyết, khắc phục cho lần làm sau.

Nguồn:

Cindy Duarte Castelão, “7 Tips for using Magnetic Beads for DNA Cleanup”, bitesizebio.

Biomedia Việt Nam